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| Registros recuperados : 32 | |
| 4. |  | ALMEIDA FILHO, J. E. de; TARDIN, F. D.; SOUZA, S. A. de; GODINHO, V. de P. C.; CARDOSO, M. J. Desempenho agronômico e estabilidade fenotípica de híbridos de sorgo granífero. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 9, n. 1, p. 54-64, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 5. | | ALMEIDA FILHO, J. E. de; TARDIN, F. D.; SOUZA, S. A. de; GODINHO, V. de P. C.; CARDOSO, M. J. Desempenho agronômico e estabilidade fenotípica de híbridos de sorgo granífero. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 9, n. 1, p. 54-64, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 7. | | RIOS, E.; RESENDE, M.; KIRST, M.; RESENDE, M. D. V. de; ALMEIDA FILHO, J. E. de; MUNOZ, P. Predictive ability of Genomic Estimated Family Values (GEFV). In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Pôster P1186.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 8. | | ALMEIDA FILHO, J. E. de; SOARES, D. C. de P.; SILVA, E. A.; CANDIDO, L. S.; TARDIN, F. D.; SOUZA, S. A. de. Avaliação agronômica de 25 híbridos simples de sorgo granífero (Sorghum bicolor) em distintas condições edafoclimáticas In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 28.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA DO CARTUCHO, 4., 2010, Goiânia. Potencialidades, desafios e sustentabilidade: resumos expandidos... Sete Lagoas: ABMS, 2010. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 9. | | ALMEIDA FILHO, J. E. de; TARDIN, F. D.; LOPES, V. da S.; BARBÉ, T. C.; GODINHO, V. de P. C.; CARDOSO, M. J.; DAHER, R. F. Correlação entre parâmetros de estabilidade e adaptabilidade em híbridos de sorgo granífero. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 6., 2011, Búzios. Panorama atual e perspectivas do melhoramento de plantas no Brasil. [Búzios]: SBMP, 2011. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 10. | | ALMEIDA FILHO, J. E. de; TARDIN, F. D.; LOPES, V. da S.; BARBÉ, T. C.; GODINHO, V. de P. C.; CARDOSO, M. J.; DAHER, R. F. Correlação entre parâmetros de estabilidade e adaptabilidade em híbridos de sorgo granífero. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 6., 2011, Búzios. Panorama atual e perspectivas do melhoramento de plantas no Brasil. [Búzios]: SBMP, 2011. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 11. | | ALMEIDA FILHO, J. E. de; GUIMARÃES, J. F. R.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; MUÑOZ, P.; KIRST, M.; RESENDE JUNIOR, M. F. R. The contribution of dominance to phenotype prediction in a pine breeding and simulated population. Heredity, v. 117, p. 33-41, July 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 12. | | ALMEIDA FILHO, J. E. de A.; RODRIGUES, J. F. G.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE JÚNIOR, M.; MUÑOZ, P.; KIRST, M. Genomic prediction of assitive and non-additive effects using genetic markers and pedigrees in pines breeding. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: SBMP: UFG, 2015. Resumo.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 13. | | ALMEIDA FILHO, J. E. de; TARDIN, F. D.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; GRANATO, I. S. C.; MENEZES, C. B. de. Genetic evaluation of grain sorghum hybrids in Brazilian environments using the REML/BLUP procedure. Scientia Agricola, Piracicaba, v. 71, n. 2, p. 146-150, Mar./Apr. 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 14. | | TARDIN, F. D.; ALMEIDA FILHO, J. E. de; OLIVEIRA, C. M. de; LEITE, C. E. do P.; MENEZES, C. B. de; MAGALHAES, P. C.; RODRIGUES, J. A. S.; SCHAFFERT, R. E. Avaliação agronômica de híbridos de sorgo granífero cultivados sob irrigação e estresse hídrico. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 12, n. 2, p. 102-117, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 15. | | ALMEIDA FILHO, J. E. de; TARDIN, F. D.; DAHER, R. F.; SILVA, K. J. da; JOÃO BATISTA XAVIER NETO; BASTOS, E. A.; LOPES, V. da S.; BARBE, T. da C.; MENEZES, C. B. de. Avaliação agronômica de híbridos de sorgo granífero em diferentes regiões produtoras do Brasil. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 13, n. 1, p. 82-95, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 16. | | DAHER, R. F.; CUNHA, R. C. V. da; ARAÚJO, V. da S.; ALMEIDA FILHO, J. E. de; GRAVINA, G. de A.; LEDO, F. J. da S.; GOTTARDO, R. D. Análise de estabilidade da produção forrageira de genótipos de capim-elefante avaliados em Campos dos Goytacazes - RJ. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 606-610| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 17. | | ALMEIDA FILHO, J. E. de; SOARES, D. C. de P.; SILVA, E. A.; CANDIDO, L. S.; TARDIN, F. D.; SOUZA, S. A. de; GODINHO, V. de P. C.; CARDOSO, M. J. Adaptabilidade e estabilidade produtiva em híbridos simples de sorgo granífero (Sorghum bicolor). In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 28.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA DO CARTUCHO, 4., 2010, Goiânia. Resumos expandidos... Goiânia: ABMS, 2010. p.2588-2594. CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 18. | | ALMEIDA FILHO, J. E. de; SOARES, D. C. de P.; SILVA, E. A.; CANDIDO, L. S.; TARDIN, F. D.; SOUZA S. A. de; GODINHO, V. de P. C.; CARDOSO, M. J. Adaptabilidade e estabilidade produtiva em híbridos simples de sorgo granífero (Sorghum bicolor). In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 28.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA DO CARTUCHO, 4., 2010, Goiânia. Potencialidades, desafios e sustentabilidade: resumos expandidos... Sete Lagoas: ABMS, 2010. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 19. | | SILVA, V. Q. R. da; DAHER, R. F.; SOUZA, M. C. de; LEDO, F. J. da S.; GRAVINA, G. de A.; GOTTARDO, R. D.; BARBÉ, T. da C.; ALMEIDA FILHO, J. E. de. Análise dialélica parcial em capim-elefante sob dois cortes de avaliação em Campos dos Goytacazes, RJ. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 6., 2011, Búzios. Panorama atual e perspectivas do melhoramento de plantas no Brasil. [Búzios]: SBMP, 2011. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Gado de Leite. |
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| 20. | | MULLER, B. S. F.; ALMEIDA FILHO, J. E. de; LIMA, B. M.; GARCIA, C. C.; MISSIAGGIA, A.; AGUIAR, A. M.; TAKAHASHI, E.; KIRST, M.; GEZAN, S. A.; SILVA JUNIOR, O. B. da; NEVES, L. G.; GRATTAPAGLIA, D. Independent and Joint-GWAS for growth traits in Eucalyptus by assembling genome-wide data for 3373 individuals across four breeding populations. The New phytologist, v. 221, n. 2, p. 818-833, 2019. Na publicação: Orzenil B. Silva-Junior.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Registros recuperados : 32 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
30/06/2016 |
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Data da última atualização: |
30/06/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
RIOS, E.; RESENDE, M.; KIRST, M.; RESENDE, M. D. V. de; ALMEIDA FILHO, J. E. de; MUNOZ, P. |
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Afiliação: |
Esteban Rios, University of Florida; Marcio Resende, RAPiD Genomics LLC; Matias Kirst, UFPR; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Janeo E. de Almeida Filho, UFV; Patricio Munoz, UFPR. |
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Título: |
Predictive ability of Genomic Estimated Family Values (GEFV). |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Pôster P1186. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genomic selection (GS) has been used to compute genomic estimated breeding values (GEBV) of individuals; however, it has only been applied to animal and major plant crops due to high costs. Besides, breeding and selection is performed at the family level in some crops. We aimed to study the implementation of genome-wide family selection (GWFS) in two loblolly pine (Pinus taeda L.) populations: i) the breeding population CCLONES composed of 63 families (5-20 individuals per family), phenotyped for four traits (stem diameter, stem rust susceptibility, tree stiffness and lignin content) and genotyped using an Illumina Infinium assay with 4740 polymorphic SNPs, and ii) a simulated population that reproduced the same pedigree as CCLONES, 5000 polymorphic loci and two traits (oligogenic and polygenic). In both populations, phenotypic and genotypic data was pooled at the family level in silico. Phenotypes were averaged across replicates for all the individuals and allele frequency was computed for each SNP. Marker effects were estimated at the individual (GEBV) and family (GEFV) levels with Bayes-B using the package BGLR in R and models were validated using 10-fold cross validations. Predicted ability, computed by correlating phenotypes with GEBV and GEFV, was always higher for GEFV in both populations, even after standardizing GEFV predictions to be comparable to GEBV. Results revealed great potential for using GWFS in breeding programs that select families, such as most outbreeding forage species. A significant drop in genotyping costs as one sample per family is needed would allow the application of GWFS in minor crops. MenosGenomic selection (GS) has been used to compute genomic estimated breeding values (GEBV) of individuals; however, it has only been applied to animal and major plant crops due to high costs. Besides, breeding and selection is performed at the family level in some crops. We aimed to study the implementation of genome-wide family selection (GWFS) in two loblolly pine (Pinus taeda L.) populations: i) the breeding population CCLONES composed of 63 families (5-20 individuals per family), phenotyped for four traits (stem diameter, stem rust susceptibility, tree stiffness and lignin content) and genotyped using an Illumina Infinium assay with 4740 polymorphic SNPs, and ii) a simulated population that reproduced the same pedigree as CCLONES, 5000 polymorphic loci and two traits (oligogenic and polygenic). In both populations, phenotypic and genotypic data was pooled at the family level in silico. Phenotypes were averaged across replicates for all the individuals and allele frequency was computed for each SNP. Marker effects were estimated at the individual (GEBV) and family (GEFV) levels with Bayes-B using the package BGLR in R and models were validated using 10-fold cross validations. Predicted ability, computed by correlating phenotypes with GEBV and GEFV, was always higher for GEFV in both populations, even after standardizing GEFV predictions to be comparable to GEBV. Results revealed great potential for using GWFS in breeding programs that select families, such as most outbreedi... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Melhoramento genético. |
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Thesagro: |
Melhoramento vegetal; Pinus Taeda. |
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Thesaurus NAL: |
Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/144954/1/2016-M.Deon-IPAG-Predicty-Ability.pdf
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Marc: |
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245 $aPredictive ability of Genomic Estimated Family Values (GEFV).$h[electronic resource]
260 $aIn: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Pôster P1186.$c2016
520 $aGenomic selection (GS) has been used to compute genomic estimated breeding values (GEBV) of individuals; however, it has only been applied to animal and major plant crops due to high costs. Besides, breeding and selection is performed at the family level in some crops. We aimed to study the implementation of genome-wide family selection (GWFS) in two loblolly pine (Pinus taeda L.) populations: i) the breeding population CCLONES composed of 63 families (5-20 individuals per family), phenotyped for four traits (stem diameter, stem rust susceptibility, tree stiffness and lignin content) and genotyped using an Illumina Infinium assay with 4740 polymorphic SNPs, and ii) a simulated population that reproduced the same pedigree as CCLONES, 5000 polymorphic loci and two traits (oligogenic and polygenic). In both populations, phenotypic and genotypic data was pooled at the family level in silico. Phenotypes were averaged across replicates for all the individuals and allele frequency was computed for each SNP. Marker effects were estimated at the individual (GEBV) and family (GEFV) levels with Bayes-B using the package BGLR in R and models were validated using 10-fold cross validations. Predicted ability, computed by correlating phenotypes with GEBV and GEFV, was always higher for GEFV in both populations, even after standardizing GEFV predictions to be comparable to GEBV. Results revealed great potential for using GWFS in breeding programs that select families, such as most outbreeding forage species. A significant drop in genotyping costs as one sample per family is needed would allow the application of GWFS in minor crops.
650 $aPlant breeding
650 $aMelhoramento vegetal
650 $aPinus Taeda
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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